On vaadeldud näiteks erinevate eeltöötlusmeetodite (ultraheli, osoon, temperatuur jne) mõju substraadi anaeroobse protsessi füüsikalisele mõjutamisele, kuid nimetatud protsessi on võimalik hoopis paremini juhtida, tundes lagundamisprotsessi läbiviivaid mikroorganisme, soodustades või takistades nende kasvu.