Natura hindamine on praktikas omandanud suure õigusliku siduvuse otsustaja jaoks – kui ebasoodne mõju ei ole välistatud, ei tohi tegevuse elluviimist lubada. Antud juhend keskendub erandile selles vallas.
Natura hindamise läbiviimise abistamiseks on koostatud juhiseid loodusdirektiivi artikli 6 lõike 4 rakendamiseks Eestis.

Seda nimetatakse erandi tegemiseks Natura hindamises. See juhendmaterjal selgitab, millised need erandolukorrad on, kuidas saab erandi tegemise etapiga alustada ning milliseid meetmeid tuleb rakendada, et vaatamata ühe või mitme ala kahjustamisele püsiks Natura 2000 alade võrgustik siiski sidusana. Samuti tuuakse näiteid teistes Euroopa Liidu liikmesriikides ettetulnud eranditegemise juhtumitest.